Вячеслав
Не претендую на 100% точность моего ответа, о существовании Psiphon 3 узнал только что от Вас.
Запустил эту программу на виртуалке в WinXP и вот что у меня получилось.
Psiphon 3 по умолчанию запустился в режиме SSH+ и открыл несколько слушающих портов. Один из них 8080 (НС не был запущен и этот порт был свободен). Запустил НС и настроил ему доступ на порт 8082 (8080 занял Psiphon 3). Браузер настроил на порт НС (8082), и в НС настроил внешний HTTP-прокси на порту 8080. В результате браузер стал работать через цепочку НС->Psiphon 3. Проверил на одном из сайтов мой IP, сайт показал IP, отличный от моего настоящего.
После этого переключил Psiphon 3 в режим VPN. В НС выключил внешний прокси. При этом трафик НС пошел все равно через Psiphon 3 (проверил по IP). На мой взгляд такой режим более предпочтителен, т.к. при этом система принудительно шлет трафик через Psiphon 3.
В обоих случаях кэш НС выполняет обычную свою работу и смягчает отрицательный эффект замедления из=за работы через Psiphon 3.
Я сделал проще. Так как у меня всегда включён НС , Psiphon 3 я прописал на порт 8081. При включении Psiphon 3 он сам заходит на 8081, так как 8080 занял НС. И в браузерах ничего менять не надо.